因為核苷類藥沒有增強免疫作用，所以停藥后的效果很不穩(wěn)定。核苷類藥直接清除復制病毒，血清中的HBV DNA很快降低到檢不出的水平，從而使肝內(nèi)炎癥熄滅，肝功正常，病情恢復。但對肝細胞內(nèi)的復制模板cccDNA并無作用，也不能直接影響病毒抗原。只是因為病毒復制水平很低，肝細胞內(nèi)的cccDNA補充減少，才能影響病毒抗原合成，治療的3-5年后，E抗原才能轉換；而慢性感染的病毒S基因都與患者肝細胞的遺傳基因有整合，殘留表面抗原（“小三陽”）很難清除。經(jīng)過漫長的年月，肝內(nèi)病毒逐漸消耗，“小三陽”才能轉陰。